home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00686 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  31 lines
  1. **************************************
  2. * Acyl-CoA-binding protein signature *
  3. **************************************
  4.  
  5. Acyl-CoA-binding protein  (ACBP) is a small (10 Kd) protein that binds medium-
  6. and long-chain  acyl-CoA esters with very high affinity and may function as an
  7. intracellular carrier  of  acyl-CoA  esters  [1].    ACBP  is  also  known  as
  8. diazepam  binding inhibitor (DBI) or endozepine (EP) because of its ability to
  9. displace diazepam  from  the  benzodiazepine (BZD) recognition site located on
  10. the GABA type A receptor. It is therefore possible that this protein also acts
  11. as a neuropeptide to modulate the action of the GABA receptor [2].
  12.  
  13. ACBP is a highly conserved  protein  of about 90 residues that has been so far
  14. found in  vertebrates,  insects  and  yeast.  ACBP  is  also related to the N-
  15. terminal section of a probable transmembrane protein of unknown function which
  16. has been found in mammals.
  17.  
  18. As a signature pattern we selected  the region  that corresponds to residue 19
  19. to 37 in mammalian ACBP.
  20.  
  21. -Consensus pattern: P-[STA]-x-[DEN]-x-[LIVM](2)-x-[LIVMFY]-Y-[GSTA]-x-[FY]-K-
  22.                     Q-A-[STA]-x-G
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: October 1993 / First entry.
  26.  
  27. [ 1] Rose T.M., Schultz E.R., Todaro G.J.
  28.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:11287-11291(1992).
  29. [ 2] Costa E., Guidotti A.
  30.      Life Sci. 49:325-344(1991).
  31.